第一段，说明雁荡山在古代长期不为人知的情况。

      第一小层（“温州雁荡山，天下奇秀，然自古图牒，未尝有言者。”）交代雁荡山所在地点，提出本段中心。

      第二小层（“祥符中……盖当时未有雁荡之名。”）说明本段中心。先说比作者早六十年的宋代“祥符中”“尚未有名”的情况。再引西域书和贯休诗说明宋代以前对雁荡山虽有零星记述，但不详细也不明确，提到了雁荡、龙湫的名字，但具体位置在哪里，人们还弄不清。最后说，南朝“谢灵运为永嘉守，凡永嘉山水，游历殆遍，独不言此山，盖当时未有雁荡之名”。

      第二段，推究雁荡诸峰形成的原因，说明它长期不为人知，是它的特殊地形造成的。

      第一小层（“予观雁荡诸峰……至谷中则森然干霄。”）描述作者实地考察所见雁荡诸峰的地形。

      第二小层（“原其理……但此土彼石耳。”）推究雁荡诸峰特殊地形的成因。

      先说明根据实地考察的推理判断：“原其理，当是为谷中大水冲激，沙土尽去，唯巨石岿然挺立耳。”然后就近从当地提出事实来作佐证：“如大小龙湫、水帘、初月谷之类……”接着进一步说明雁荡诸峰的现象不是个别的，“世间沟壑中水凿之处，皆有植土龛岩，亦此类耳。”紧接着又就别处提出事实来作佐证：“今成皋、陕西大涧中……”

      第三小层（“既非挺出地上……理不足怪也。”）结论。呼应第一段，说明“雁荡山，天下奇秀，然自古图牒，未尝有言者”的原因。

      从上面的结构分析可以看出，本文说明的顺序是先发现问题，提出问题（第一段），再分析问题（包括观察、分析、判断、取证），最后解决问题（第二段）。这是由结果（特殊地形）分析原因（特殊地形的成因）的逻辑顺序，前后两段逻辑联系非常紧密。

      第一段说明“自古图牒，未尝有言者”的表达方式以叙述为主，第二段分析“自古图牒，未尝有言者”的原因则以论说为主。